学院拥有国家自然科学基金创新群体、欧空局SWARM卫星计划中国数据中心、空间环境监测与行星可宜居性工信部重点实验室、卫星导航与移动通信融合技术工信部重点实验室、中非北斗卫星导航系统及遥感应用联合实验室、科技部“空天物理国家国际科技合作基地” 、北航-中科院空间科学科教合作中心、北航国际交叉研究院 2.0空间环境与行星科学中心、地球与行星空间环境科教协同创新平台、西山空间极弱磁场屏蔽实验室等重要科研平台和基地，为科研工作提供了坚实的基础。

同时，学院拥有“空间探测技术与工程实验室”和“空间等离子体应用技术”等本科教学实验室、北航-数字太空（北京）共建本科生校外人才培养基地、北航-国家空间科学中心专业学位研究生实习实践基地，并与千寻位置网络有限公司、上海华测导航技术股份有限公司、北京北斗星通导航技术股份有限公司、和芯星通科技（北京）有限公司、真点科技（北京）有限公司、北京赛微电子股份有限公司、北斗导航位置服务（北京）有限公司、北京华力创通科技股份有限公司等9家公司共同建设了研究生实习实践基地，以国家航天和导航科研成果反哺教学，实践育人，大力提高航空航天特色的空间和导航科学专业人才培养质量。